This table contains a list of anatomical terms, called classes, and their corresponding definitions that were incorporate into the current release of the Planarian Anatomy Ontology (PLANA). You can learn more able PLANA on our Anatomy Ontology Page. If you find an error or a missing structure, please suggest edits and additions here.
Classes with a star (☆) indicate pages with in-depth written descriptions, associated supplemental figures, in situ hybridization images and sequences for transcripts validated by WISH.
Search for an exact term, words that appear in a term’s definition or for synonyms of a term below. If you are searching exact and not getting results, search synonyms first.
| term | definition | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Stage 3-5 embryo hemisphere centered around the pole opposite the embryonic pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand aboral hemisphere relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| One of two distinct histochemical classes of gland cells, these can be found throughout the body but primarily form clusters of subepidermal marginal adhesive glands along the dorsoventral border of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand acidophilic gland cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell projection supported by an assembly of actin filaments. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand actin-based cell projection relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Rhabdites that are located basally to the epidermis, in the mesenchyme. In Smed these are present in cells likely on their way to becoming part of the mature epidermis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand adenal rhabdite relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell junction at which anchoring proteins (cadherins or integrins) extend through the plasma membrane and are attached to actin filaments. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand adherens junction relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Groupings of specialized epithelial cells located along the dorsal ventral margin. Adhesion glands are comprised of three cell types, the viscid and releasing gland cells which penetrate through an epithelial anchor cell and terminate at the epidermal surface. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand adhesion gland relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the adhesion gland | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Finger-like processes at the terminal pore of adhesive gland cells around the marginal adhesive zone. They protrude past the epidermis and are longer microvilli, and shorter than cilia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand adhesive papilla relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A fully formed, sexually mature organism that reproduces through cross-fertilization. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand adult hermaphrodite relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron which conveys sensory information centrally from the periphery. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand afferent neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A wound resulting in two or more separate tissue fragments. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand amputation relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| germ cell cyst undergoing mitotic anaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anaphase germ cell cyst relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neoblast undergoing mitotic anaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anaphase neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial cell undergoing mitotic anaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anaphase oogonial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial stem cell undergoing mitotic anaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anaphase oogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonium undergoing mitotic anaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anaphase spermatogonia relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonial stem cell undergoing mitotic anaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anaphase spermatogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A subdivision of an anatomical compartment. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anatomical region relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Multicellular, connected anatomical structure that has multiple organs as parts and whose parts work together to achieve some shared function. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anatomical system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specialized epithelial cell located along the dorsoventral margin that surrounds the viscid and releasing gland cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anchor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A bundle of nerve fibers connecting the two cephalic ganglia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior commissure relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A fragment encompassing all or part of the anterior region of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A branch of the triclad gut located anterior to the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior gut branch relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| anterior region of the eye of photoreceptor neuron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior photoreceptor neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Distinct anterior cluster of muscle cells located at the midline which express notum, follistatin, zic-1, and foxD. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior pole relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the anterior pole | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| piwi-1+, foxD+, prep+ progenitor neoblasts required for formation of the anterior pole. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior pole progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Axis that runs along the long axis of the animal from anterior (head) to posterior (tail). It is perpendicular to the dorsoventral axis and as such, it splits dorsal and ventral regions of the animal to either side. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior-posterior axis of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The single, central gut branch of the triclad gut anterior to the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior primary gut branch relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment encompassing all or part of the anterior region of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of anterior fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from a prepharyngeal amputation encompassing the head. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of head fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from an amputation parallel to or along any edge, which overlaps the lateral region, dorso-lateral region, ventro-lateral region, antero-lateral margin, lateral margin, ventro-lateral margin, postero-lateral margin, dorso-lateral margin, antero-lateral region, postero-lateral region. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of lateral fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from an amputation parallel to the midline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of longitudinal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a 3D piece of tissue, usually though the whole depth of the animal encompassing both dorsal and ventral sides, often made with a biopsy punch. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of plug fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment encompassing all or part of the posterior region of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of posterior fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from two postpharyngeal amputations, removing the anterior region and the tail tip. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of postpharyngeal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from two prepharyngeal amputations, removing the head and posterior regions of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of prepharyngeal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from a postpharyngeal amputation encompassing the tail. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of tail fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of the eye. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of the eye relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compartment along the anteroposterior axis closer to the head rather than the tail, from the head margin to the esophagus. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a fragment derived from pre- and post-pharyngeal amputations, encompassing the pharynx and parapharyngeal region. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of trunk fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior region of a piece of tissue removed from the lateral margin at any given point that extendes interiorly to more medial structures. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior region of wedge fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The anterior-medial region of the head margin. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand anterior tip relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A chamber formation in an organ. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand antrum relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The apical surface of the single layered epidermis that is in contact with the environment. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand apical surface of the epidermis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Asexually reproducing Schmidtea mediterranea exist as constitutive adults, undergoing successive cycles of fission and whole animal regeneration. Asexual Schmidtea mediterranea contain primordial germ cells, but do not possess a reproductive system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand asexual adult relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An individual member of the asexual biotype of Schmidtea mediterranea. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand asexual organism relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A sense organ located along the dorsolateral head margin. The auricular groove is highly innervtated by ciliated sensory neurons, and has an altered epidermis devoid of rhabdites and gland cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand auricle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neruon whose cell body is within an autonomic ganglion. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand autonomic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The long process of a neuron that conducts nerve impulses, usually away from the cell body to the terminals and varicosities, which are sites of storage and release of neurotransmitter. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand axon relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The bundle of microtubules and associated proteins that forms the core of cilia (also called flagella) in eukaryotic cells and is responsible for their movements. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand axoneme relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A group of axons linking two or more neuropils and having a common origin, termination | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand axon tract relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A membrane-tethered, short cylindrical array of microtubules and associated proteins found at the base of a eukaryotic cilium (also called flagellum) that is similar in structure to a centriole and derives from it. The cilium basal body is the site of assembly and remodelling of the cilium and serves as a nucleation site for axoneme growth. As well as anchoring the cilium, it is thought to provide a selective gateway regulating the entry of ciliary proteins and vesicles by intraflagellar transport. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand basal body relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Acellular anatomical structure that consists of a thin sheet of fibrous proteins that underlie and support the cells of an epithelium. It separates the cells of an epithelium from any underlying tissue. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand basal lamina of epithelium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The basal surface of the epidermis in direct contact with the basal lamina. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand basal surface of the epidermis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| One of two distinct histochemical classes of gland cells, these are found near the ventral mesenchyme, the pharynx and in the dorsal region of the head. May also be called cyanophilic gland cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand basophilic gland cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand biological entity relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organisms sharing a specified genotype or karyotype. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A type of interneuron that has two neurites, usually an axon and a dendrite, extending from opposite poles of an ovoid cell body. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand bipolar neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A regenerating tissue composed of a proliferative mass of undifferentiated progenitor cells from which new differentiated structures arise. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand blastema relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An undifferentiated, cycling embryonic cell in Stage 1-5 embryos that expresses piwi-1, numerous adult asexual neoblast enriched genes, and early embryo enriched genes. Blastomeres give rise to temporary embryonic tissues during Stage 2, continue dividing asynchronously in the embryonic wall, and ultimately give rise to neoblasts and adult lineage progenitors beginning in Stage 5. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand blastomere relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the body wall musculature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any collection of muscles that is part of a body wall [Automatically generated definition]. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand body wall musculature relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Examples include the outer membranes of double membrane bound organelles such as mitochondria as well as the bounding membranes of single-membrane bound organelles such as lysosomes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand bounding membrane of organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| any of the nerve fiber tracts that span the longitudinal fissure between the cerebral and/or cerebellar hemispheres of the brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand brain commissure relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region of the cephalic ganglia innervated by the optic nerve (posterior-projecting photoreceptor neuron fasiculated axons). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand brain visual center relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An enlarged portion of the seminal vesicle, comprised of secretory epithelial cells, that connects to the ejaculatory duct within the penis papilla. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand bulbar cavity relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The passageway connecting the genital atrium to the copulatory bursa. Part of the copulatory apparatus. During mating, sperm from a partner is deposited into the bursal canal, where it collects in the copulatory bursa before travelling up the oviducts to the tuba. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand bursal canal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Irradiation-sensitive, mesenchymal cells that are absent from the head region anterior to the eyes and the pharynx. The Category 1 designation encompasses the neoblast population. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Category 1 cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Post-mitotic, mesenchymally located epidermal progenitors downstream of the zeta neoblasts. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Category 2 cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Post-mitotic, mesenchymally located epidermal progenitors downstream of the Category 2 cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Category 3 cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Post-mitotic, mesenchymally and epidermally located progenitors downstream of the Category 3 cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Category 4 cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Post-mitotic, ciliated epidermal cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Category 5 cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A material entity of anatomical origin (part of or deriving from an organism) that has as its parts a maximally connected cell compartment surrounded by a plasma membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The portion of a cell bearing surface projections such as axons, dendrites, cilia, or flagella that includes the nucleus, but excludes all cell projections. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell body relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The attachment of one cell to another cell via adhesion molecules. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell-cell adhesion relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Extended zone of intimate apposition between two cells containing one or more types of intercellular junctions. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell-cell contact zone relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell junction that forms a connection between two or more cells in a multicellular organism; excludes direct cytoplasmic junctions such as ring canals. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell-cell junction relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cellular component that forms a specialized region of connection between two or more cells or between a cell and the extracellular matrix. At a cell junction, anchoring proteins extend through the plasma membrane to link cytoskeletal proteins in one cell to cytoskeletal proteins in neighboring cells or to proteins in the extracellular matrix. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell junction relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A prolongation or process extending from a cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cell projection relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glands surrounding the genital atrium that are required for production of the proteinaceous egg capsule shell and stalk. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cement gland relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The central nervous system is the core nervous system that serves an integrating and coordinating function. In vertebrates it consists of the neural tube derivatives: the brain and spinal cord. In invertebrates it includes central ganglia plus nerve cord. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand central nervous system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any neuron that is part of a central nervous system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand central nervous system neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The planarian brain, consisting of two bilaterally symmetric lobes occupying a ventral position in the head. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cephalic ganglia relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| One of two bilaterally symmetric structures comprising the planarian brain. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cephalic ganglia lobe relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A central nervous system neuron located within the planarian brain. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cephalic ganglia neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| This primordium develops into cephalic ganglia | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cephalic ganglia primordium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A progenitor cell that gives rise to one or more of the cell type(s) in the nervous system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cephalic ganglia progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Amputation carried out by application of chemicals. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chemical amputation relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Amputation of the phaynx, including the esophagus, by treatment with Sodium Azide. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chemical pharynx amputation relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An intentional wound produced by non-autonomous chemical means. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chemical wound relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any neuron that capable of some detection of chemical stimulus involved in sensory perception. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chemosensory neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurons that express choline acetyltransferase. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cholinergic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The ordered and organized complex of DNA, protein (histones), and sometimes RNA, that forms the chromosome. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chromatin relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A membrane-less, cytoplasmic ribonucleoprotein granule present in neoblasts and germ cells implicated in post-transcriptional regulation. The RNA helicase DHH1/RCK, Tudor, SmB, methylated substrates of PRMT5, PIWI-3 and Germinal Histone H4 localize to chromatoid bodies in neoblasts. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chromatoid body relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| structural element of a chromosome, for example, a telomere and a centromere | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chromosomal_structural_element relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A structure composed of a very long molecule of DNA and associated proteins (e.g. histones) that carries hereditary information. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chromosome relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Under the microscope chromosomes appear as thin, thread-like structures. They all have a short arm and long arm separated by a primary constriction called the centromere. The short arm is designated as p and the long arm as q. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chromosome arm relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| This is a manufactured term, that serves the purpose of allow the parts of a chromosome to have an is_a path to the root. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand chromosome part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An epithelial cell that has cilia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ciliated epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Epithelium bearing vibratile cilia on the free surface. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ciliated epithelium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A specialized eukaryotic organelle that consists of a filiform extrusion of the cell surface and of some cytoplasmic parts. Each cilium is largely bounded by an extrusion of the cytoplasmic (plasma) membrane, and contains a regular longitudinal array of microtubules, anchored to a basal body. The longitudinal array of microtubules are almost always in a 9+2 array with 2 microtubles in the central cilia bundle and 9 sets of doublet microtubules around the perimeter. The exception to this arrangement is spermatazoa flagella, which have a 9+1 array in planarians. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cilium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A subset of sensory neurons located along the dorsal head margin. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cintillo+ sensory neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Body wall muscle fibers arrayed around the dorsoventral axis. Upon regeneration, these are thought to be produced de novo in the blastema. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand circular muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| piwi-1+, nkx1-1+ progenitor neoblasts required for specification of circular muscle fibers. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand circular muscle progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pluripotent piwi-1+ stem cells that self-renew, form expanding colonies and produce differentiating daughters that contribute to multiple organ systems. cNeoblasts are predicted to be broadly distributed across the anteroposterior axis of the adult worm. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand clonogenic neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-ciliated tubules associated with the distal tubules, which cross the basement membrane and terminate in the dorsal epidermis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand collecting duct relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nonciliated epithelial cells that assemble into collecting ducts. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand collecting duct epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron that has an axon which crosses the midline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand commissural neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A bundle of nerve fibers crossing from one side to the other side of the brain or spinal cord. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand commissure relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accessory reproductive structures involved in copulation, egg capsule development and laying. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand copulatory apparatus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An organ that receives and stores sperm from mating partners. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand copulatory bursa relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Portion of the sexual biotype body plan immediately posterior to the parapharyngeal region, and immediately anterior to the tail. Encompasses the copulatory apparatus. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand copulatory region relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A wound or cleft resulted from tissue separation into parts or laid open or penetrated with a sharp edge or instrument. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cut relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| All of the contents of a cell excluding the plasma membrane and nucleus, but including other subcellular structures | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cytoplasm relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any constituent part of the cytoplasm, all of the contents of a cell excluding the plasma membrane and nucleus, but including other subcellular structures. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cytoplasmic part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any constituent part of cytoplasmic vesicle, a vesicle formed of membrane or protein, found in the cytoplasm of a cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand cytoplasmic vesicle part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical structure which is a subdivision of a whole adult or juvenile organism, consisting of components of multiple anatomical systems. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand definitive organism subdivision relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron projection that has a short, tapering, morphology. Dendrites receive and integrate signals from other neurons or from sensory stimuli, and conduct nerve impulses towards the axon or the cell body. In most neurons, the impulse is conveyed from dendrites to axon via the cell body, but in some types of unipolar neuron, the impulse does not travel via the cell body. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dendrite relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cells isolated from dissociated planarian tissue. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand derived cell population relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Body wall muscle fibers arrayed diagonally along the anteroposterior axis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand diagonal muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing diakinesis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand diakinesis stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical system that has as its parts the organs devoted to the ingestion, digestion, and assimilation of food and the discharge of residual wastes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand digestive system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An anatomical space that is surrounded by a digestive tract. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand digestive tract lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing diplotene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand diplotene stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sinusoidal, non-ciliated tubules connected to proximal tubules within the parenchyma. Tubules are formed via intercellular junctions between two epithelial cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand distal tubule relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nonciliated epithelial cells that assemble into protonephridial distal tubules. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand distal tubule epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron that expresses the neurotransmitter dopamine. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dopaminergic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the dorsal region of the epidermis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal epidermis cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A progenitor cell that gives rise to one or more of the cell type(s) in the dorsal epidermis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal epidermis progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The median line/plane of bilateral symmetry along the anteroposterior axis on the dorsal surface of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal midline relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment encompassing all or part of the anterior region of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of anterior fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from a prepharyngeal amputation encompassing the head. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of head fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from an amputation parallel to or along any edge, which overlaps the lateral region, dorso-lateral region, ventro-lateral region, antero-lateral margin, lateral margin, ventro-lateral margin, postero-lateral margin, dorso-lateral margin, antero-lateral region, postero-lateral region. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of lateral fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from an amputation parallel to the midline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of longitudinal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a 3D piece of tissue, usually though the whole depth of the animal encompassing both dorsal and ventral sides, often made with a biopsy punch. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of plug fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment encompassing all or part of the posterior region of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of posterior fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from two postpharyngeal amputations, removing the anterior region and the tail tip. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of postpharyngeal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from two prepharyngeal amputations, removing the head and posterior regions of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of prepharyngeal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of the tail. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of tail relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from a postpharyngeal amputation encompassing the tail. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of tail fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Single cell layer of dorsal, post-mitotic, epithelial cells containing the dorsal stripe. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of the epidermis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Three dimensional compartment along the dorsoventral axis that is above the anteroposterior axis, containing the eyes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The dorsal region of a fragment derived from pre- and post-pharyngeal amputations, encompassing the pharynx and parapharyngeal region. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal region of trunk fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ciliated epithelial cells along the dorsal midline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal stripe relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Axis that runs along the short axis of the animal, perpendicular to the anteroposterior axis, running from the dorsal (back) side of the animal to the ventral (belly) side of the animal. This axis splits anterior and posterior regions of the animal to either side. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal-ventral axis of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region along the edge of the animal where the dorsal and ventral surfaces meet. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal ventral margin of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A muscle cell that runs in the transverse plane that connects the dorsal and ventral sides of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand dorsal-ventral muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A premeiotic female germ cell (i.e., a diploid female germline stem cell or transit amplifying oogonial cell). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand early female germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A premeiotic male germ cell (i.e., a spermatogonial stem cell or transit amplifying spermatogonial cell). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand early male germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turbellarian (freshwater flatworm) embryos that undergo a modified form of cleavage due to separation of oocyte and yolk. Yolk is not contained within oocytes, and is produced by somatic vitellogenic gland cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ectolecithal embryo relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron which sends impulses peripherally to activate muscles or secretory cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand efferent neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A proteinaceous, semi-permeable shell housing yolk cells and one or more embryos.Egg capsules are anchored to a substrate via a stalk. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand egg capsule relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell whose function is determined by its response to an electric signal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand electrically responsive cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell that initiates an electrical signal and passes that signal to another cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand electrically signaling cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spermatids expressing protein kinase A undergoing morphogenic changes to make mature sperm. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand elongate spermatid relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical entity that comprises the organism in the early stages of growth and differentiation that are characterized by cleavage, the laying down of fundamental tissues, and the formation of primitive organs and organ systems. For example, for mammals, the process would begin with zygote formation and end with birth. For insects, the process would begin at zygote formation and end with larval hatching. For plant zygotic embryos, this would be from zygote formation to the end of seed dormancy. For plant vegetative embryos, this would be from the initial determination of the cell or group of cells to form an embryo until the point when the embryo becomes independent of the parent plant. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryo relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell of the embryo. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cryptic digestive system in Stage 3-6 embryos comprised of temporary embryonic cell types and organs, including the embryonic pharynx and primitive gut cells. Embryonic gut cells, likely produced from blastomeres, form a phagocytic tissue layer surrounding the inner gut cavity during Stages 4-6. It is not known whether the embryonic gut is temporary embryonic tissue or a definitive tissue. For convenience, the embryonic gut is currently designated as an extraembryonic structure because cell type specific markers for the embryonic gut do not stain the definitive gut in hatchlings or adult animals. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic digestive system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cryptic digestive cavity comprised of phagocytic embryonic gut cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic gut relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cavity encompassed by the embryonic digestive tract, prior to formation of the branched defintive gut. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic gut cavity relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dispersed, phagocytic gut cells that appear during Stage 4 and ultimately generate a honeycomb-like lattice surrounding the central gut cavity in Stage 5 embryos. Early embryonic gut cell specific transcripts are expressed from Stage 4-6, and are downregulated during Stage 7. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic gut cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The surface of phagocytic embryonic gut cells in contact with ingested yolk cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic gut cell surface relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An innervated, muscular pump that ingests yolk cells into the gut cavity. The embryonic pharynx is an extraembryonic tissue that forms during Stage 2, functions during Stages 3-5, and degenerates during Stages 6-7. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Differentiated muscle cell present in a circular muscle fiber of the embryonic pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx circular muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| foxA1+ epithelial cell contained in the embryonic pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A lumen enclosed by the embryonic pharynx epithelial cells through which yolk cells are transported into the embryonic gut cavity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The epithelial cell surface lining the embryonic pharynx lumen. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx lumen epithelial surface relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuronal cell innervating the embryonic pharynx. Four neurons innervate the radial muscle fibers that ring the oral opening. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Differentiated radial muscle cell present in the embryonic pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic pharynx radial muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical structure that is part of an embryo. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic structure relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical structure which is a subdivision of a whole developing/ embryonic organism, consisting of components of multiple anatomical systems. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic subdivision relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The parenchymal space between the gut cavity and the primitive ectoderm containing undifferentiated blastomeres in Stage 3-5 embryos. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand embryonic wall relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Network of interconnected, flattened, and/or tubular membrane, known as cisternae. This membrane is contiguous with the outer nuclear membrane. The endoplasmic reticulum is involved in both protein and lipid synthesis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand endoplasmic reticulum relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the enteric musculature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand enteric muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Visceral muscle surrounding the gut. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand enteric musculature relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neruon whose cell body is within an autonomic ganglion. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand enteric neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An epithelial cell of the integument (the outer layer of an organism). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epidermal cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mitotically active zeta neoblasts and their post-mitotic descendants which undergo progressive differentiation and outward directed movement through the mesenchyme prior to incorporation into the epidermis, where terminal differentiation occurs. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epidermal progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Rhabdites located within epidermal cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epidermal rhabdite relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A single cell layer of post-mitotic epithelial cells containing ciliated and non-ciliated cell types forming the exterior surface of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epidermis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell that is usually found in a two-dimensional sheet with a free surface. The cell has a cytoskeleton that allows for tight cell to cell contact and for cell polarity where the apical part is directed towards the lumen and the basal part to the basal lamina. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A part of an epithelial cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epithelial cell component relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The avascular cellular layers that cover body surfaces and cavities and may form glands. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand epithelium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The lipid bilayer surrounding the endoplasmic reticulum. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ER membrane relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Attachment between the triclad gut and the proximal end of the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand esophagus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A dispersed and relatively uncompacted form of chromatin. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand euchromatin relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The black pigment that gives non-neuronal pigment cells of the optic cup their characteristic color. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand eumelanin relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A motor neuron that is capable of directly inducing muscle contraction. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand excitatory motor neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell involved in the elimination of metabolic and foreign toxins, and in maintaining the ionic, acid-base and water balance of biological fluids. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand excretory cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A structure lying external to one or more cells, which provides structural support, biochemical or biomechanical cues for cells or tissues. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand extracellular matrix relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function, occurring outside the cell. Includes, for example, extracellular membrane vesicles (EMVs) and the cellulosomes of anaerobic bacteria and fungi. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand extracellular organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| That part of a multicellular organism outside the cells proper, usually taken to be outside the plasma membranes, and occupied by fluid. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand extracellular space relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Post-mitotic, terminally differentiated cells which, give rise to temporary embryonic tissues. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand extraembryonic cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organ that is associated with an embryo and derived from the zygote from which it develops, but which does not contribute to the embryo proper or to structures that are part of the same organism after embryogenesis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A multicellular anatomical structure that is associated with an embryo and derived from the zygote from which it develops, but which does not contribute to the embryo proper or to structures that are part of the same organism after embryogenesis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand extraembryonic structure relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An organ that detects light. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand eye relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the eye | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand eye cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| This primordium develops into eye | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand eye primordium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any number of cells from dissociated planarian tissue sorted via a FACS sorter for any parameter. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand FACS sorted cell population relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Female germ cell is a germ cell that supports female gamete production. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand female germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cells expressing nanos that are located ventrally in the location that the ovaries form. Primordial germ cells are present in both asexual adults and sexual hermaphrodites. This term may be redundant with oogonial stem cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand female primordial germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A form of asexual reproduction resulting in self-amputation of posterior tissue, generating an anterior fragment and a fission fragment. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand fission relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A fragment derived from a spontaneous or induced fission event. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand fission fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transverse anatomical plane, located approximately 1-2 mm from the posterior extremity of an adult animal, at which fission occurs. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand fission plane relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Planarian undulipodia consisting of spermatazoa cell posterior protrusions. Planarian spermatozoa contain two flagella and are composed of 9 + 1 axonemal microtubule arrangements in their flagella (markedly different from the 9 + 2 structures generally observed in sperm of other animals). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand flagellum relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Terminal structure of protonephridia unit; consists of flame cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand flame bulb relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Terminal structure of the protonephridia unit, capping the proximal tubules. Flame cells are defined by the filtration weir or filtration diaphragm, which consists of closely apposed strands of cytoplasm surrounding a central cilia bundle, and by numerous microvilli between weir and cilia. Positive for acetyated tubulin. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand flame cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| lumen which is part of the flame cell | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand flame cell lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A piece of tissue isolated from the body. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| germ cell cyst undergoing mitotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G1 phase germ cell cyst relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neoblast undergoing mitotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G1 phase neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial cell undergoing mitotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G1 phase oogonial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial stem cell undergoing mitotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G1 phase oogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonial stem cell undergoing mitotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G1 phase spermatogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonium undergoing mitotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G1 phase spermatogonium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| germ cell cyst undergoing mitotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G2 phase germ cell cyst relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neoblast undergoing mitotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G2 phase neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial cell undergoing mitotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G2 phase oogonial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial stem cell undergoing mitotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G2 phase oogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonial stem cell undergoing mitotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G2 phase spermatogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonium undergoing mitotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand G2 phase spermatogonium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurons that express glutamine decarboxylase. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand GABAergic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A mature sexual reproductive cell having a single set of unpaired chromosomes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gamete relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An abundant neoblast subclass, exhibiting enriched expression of gata456a, hnf4, prox-1 and nkx2.2, implicated in maintenance and regeneration of the definitive gut. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gamma neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A biological tissue mass of nerve cell bodies. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ganglion relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell-cell junction composed of pannexins or innexins and connexins, two different families of channel-forming proteins. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gap junction relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the gastrodermis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gastrodermal cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A thin net of single nerve fibers located around the gut. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gastrodermal plexus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The single cell layer columnar epithelial lining of the intestine. The gastrodermis is surrounded by a basal lamina and enteric muscle. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gastrodermis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The surface of the gastrodermis in contact with the gut lumen. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gastrodermis surface relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A chamber where egg capsules are formed. One or more zygotes and yolk cells produced by the vitelline glands collect in the genital atrium; glands surrounding the genital atrium produce the egg capsule shell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand genital atrium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1. A gamete (as an egg or sperm cell) or one of its antecedent cells. 2. A mature male or female germ cell usually possessing a haploid chromosome set and capable of initiating formation of a new diploid individual by fusion with a gamete of the opposite sex. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A clonally-related group of interconnected spermatogonial or oogonial cells, enveloped by somatic gonadal cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand germ cell cyst relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stem cell that is the precursor of gametes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand germline stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specialized insunk epithelial cells located in the mesenchyme that participate in mucus secretion. They are characterized by elongated cell bodies with long cytoplasmic projections that terminate between, or penetrate directly throughepithelial cells and form a secretory pore at the surface. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gland cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A non-neuronal cell of the nervous system. They not only provide physical support, but also respond to injury, regulate the ionic and chemical composition of the extracellular milieu, guide neuronal migration during development, and exchange metabolites with neurons. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand glial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurons that express the biogenic amine glutamate. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand glutamatergic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytoplasmic bead-like structures of animal cells, visible by electron microscope. Each granule is a functional unit with the biosynthesis and catabolism of glycogen being catalyzed by enzymes bound to the granule surface. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand glycogen granule relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secretory cells that release digestive enzymes into the lumen of the intestine. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand goblet cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A compound membranous cytoplasmic organelle of eukaryotic cells, consisting of flattened, ribosome-free vesicles arranged in a more or less regular stack. The Golgi apparatus differs from the endoplasmic reticulum in often having slightly thicker membranes, appearing in sections as a characteristic shallow semicircle so that the convex side (cis or entry face) abuts the endoplasmic reticulum, secretory vesicles emerging from the concave side (trans or exit face). In vertebrate cells there is usually one such organelle, while in invertebrates and plants, where they are known usually as dictyosomes, there may be several scattered in the cytoplasm. The Golgi apparatus processes proteins produced on the ribosomes of the rough endoplasmic reticulum; such processing includes modification of the core oligosaccharides of glycoproteins, and the sorting and packaging of proteins for transport to a variety of cellular locations. Three different regions of the Golgi are now recognized both in terms of structure and function: cis, in the vicinity of the cis face, trans, in the vicinity of the trans face, and medial, lying between the cis and trans regions. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Golgi apparatus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reproductive organ that produces and releases eggs (ovary) or sperm (testis). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gonad relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| This primordium develops into gonad | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gonad primoridium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The gonopore, a component of the copulatory apparatus, is an opening located on the ventral side of the animal posterior to the pharynx. The gonopore is the sole point of exit and entry for the reproductive system, allowing from reciprocal exchange of sperm during copulation and egg capsule laying. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gonopore relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The planarian triclad gut contains a central anterior gut branch connected to two posterior gut branches arranged around the pharynx. Secondary gut branches extend laterally from the primary gut branches, while tertiary gut branches extend from the secondary branches. Food and waste enter and exit the gut through the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gut relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The triclad planarian gut is serially bifrucated into connected lumens where each bifrucation is a branch. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand gut branch relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The head is the anterior-most division of the body [GO]. A three dimensional compartment bounded by the anterior margin or the head and the posterior boundary of the cephalic ganglia (brain). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand head relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| blastema which develops into head | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand head blastema relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A fragment derived from a prepharyngeal amputation encompassing the head. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Peripheral region of the head. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand head margin relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A compact and highly condensed form of chromatin. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand heterochromatin relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROG-2-5 positive granules that range in size from 0.5um to 1um present in epithelia and epithelia progenitor cells. These are distinct from rhabdites. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand Hyman vesicle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A breach of the epidermis made with a defined edge or point. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand incision relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inner most body wall muscle fibers arrayed along the anteroposterior axis. These fibers are thicker than the outer longitudinal muscle fibers. The pattern of these muscles differs along the dorsoventral axis, with the dorsal arrangement converging at the central zone of the anterior pole. The ventral arrangement is more parallel or may diverge slightly as it approaches the ventral pole. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand inner longitudinal muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gland or secretory cells sandwiched between muscle and epidermal layers in the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand inner zone of gland cells relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Connected anatomical system that forms a barrier between an animal and its environment. In vertebrates, the integumental system consists of the epidermis, dermis plus associated glands and adnexa such as hair and scales. In invertebrates, the integumental system may include cuticle. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand integumental system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell junction that forms a connection between two or more cells in a multicellular organism; excludes direct cytoplasmic junctions such as ring canals. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intercellular junction relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Most generally any neuron which is not motor or sensory. Interneurons may also refer to neurons whose axons remain within a particular brain region as contrasted with projection neurons which have axons projecting to other brain regions. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand interneuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Absorptive digestive cells that engulf food particles for intracellular digestion. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intestinal phagocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytoplasmic part which forms a distinctive granular particle, which may or may not be visible using light microscopy. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intracellular granule relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function, bounded by a single or double lipid bilayer membrane and occurring within the cell. Includes the nucleus, mitochondria, plastids, vacuoles, and vesicles. Excludes the plasma membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intracellular membrane-bounded organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function, not bounded by a lipid bilayer membrane and occurring within the cell. Includes ribosomes, the cytoskeleton and chromosomes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intracellular non-membrane-bounded organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function, occurring within the cell. Includes the nucleus, mitochondria, plastids, vacuoles, vesicles, ribosomes and the cytoskeleton. Excludes the plasma membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intracellular organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any constituent part of the living contents of a cell; the matter contained within (but not including) the plasma membrane, usually taken to exclude large vacuoles and masses of secretory or ingested material. In eukaryotes it includes the nucleus and cytoplasm. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand intracellular part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A sexually immature member of the Schmidtea mediterranea sexuallly reproducing biotype. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand juvenile relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| piwi-1+, klf+ progenitor neoblasts required for production of cintillo+ sensory neurons. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand klf+ sensory neuron progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nerve branches that extend from the lateral side of each cephalic ganglia lobe. Each lobe has nine lateral branches which terminate in sensory organs. Evidence suggests they play a role in chemosensation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lateral branch relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A fragment derived from an amputation parallel to or along any edge, which overlaps the lateral region, dorso-lateral region, ventro-lateral region, antero-lateral margin, lateral margin, ventro-lateral margin, postero-lateral margin, dorso-lateral margin, antero-lateral region, postero-lateral region. [SMR: a fragment that encompasses the side of the animal, not necessarily longituduinal, or parallel to the midline] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lateral fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A nerve extending laterally from the ventral nerve cord that innervates the submuscular plexus. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lateral nerve relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The lateral region of the medio-lateral axis of the whole animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lateral region of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Axis perpendicular to both the anteroposterior and dorsoventral axis that runs from the left side of the animal, through the medial region (center) and out to the right side. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand left-right axis of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing leptotene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand leptotene stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An amputation performed with a transverse, oblique or longitudinal cut. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand linear amputation relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A breach of the epidermis and optionally down into other structures though an insult with a knife or other instrument, such that the movement includes the z direction and one or more of the x y direction. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand linear incision relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An intracellular non-membrane-bounded organelle comprising a matrix of coalesced lipids surrounded by a phospholipid monolayer. May include associated proteins. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lipid droplet relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| a fragment derived from an amputation parallel to the midline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand longitudinal fragment relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Body wall muscle fibers arrayed along the anteroposterior axis. Upon regeneration, these muscles are thought to be established from truncated pre-existing fibers.Inner most body wall muscle fibers arrayed along the anteroposterior axis. These fibers are thicker than the outer longitudinal muscle fibers. The pattern of these muscles differs along the dorsoventral axis, with the dorsal arrangement converging at the central zone of the anterior pole. The ventral arrangement is more parallel or may diverge slightly as it approaches the ventral pole. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand longitudinal muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| piwi-1+, myoD+, snail-1+ progenitor neoblasts required for specification and creation of longitudinal muscle fibers. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand longitudinal muscle progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A region bounded by any sagittal plane though the animal and the left or right side of the animal. NOTE: sagittal plane is an anatomical plane that divides a bilateral body into left and right parts, not necessarily of even size | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand longitudinal region relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The cavity or channel within a tube or tubular organ such as a blood vessel or the intestine. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The digestive component of the cell. They are homogenous, dense, membrane bound organelles filled with acid hydrolases which break down polymers. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand lysosome relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A male germ cell is a germ cell that supports male gamete production. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand male germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cells coexpressing piwi-1 and nanos that are required for male gonad formation. Primordial germ cells are present in both asexual adults and sexual hermaphrodites. This term may be redundant with spermatogonial stem cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand male primordial germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Zone present along the lateral dorsoventral boundary that sits just underneath the animal, in contact with substrates. It is comprised of bunches of adhesion gland cells whose terminal pores form pore rosettes through the dorsal ventral boundary epidermis.This region of is devoid of rhabdites. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand marginal adhesive zone relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell specialized to transduce mechanical stimuli and relay that information centrally in the nervous system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand mechanoreceptor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any neuron that is capable of some detection of mechanical stimulus involved in sensory perception. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand mechanosensory neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Axis that runs from the center of the body, starting at the anteroposterior axis and out to the lateral (left, right, dorsal or ventral) surface of the animal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand medial-lateral axis of the whole animal relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subset of dorsal-ventral muscle cells located in the medial body region. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand medial muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiosis II cell cycle phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiosis II stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic anaphase II | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic anaphase II spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic anaphase I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic anaphase I stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic G1 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic G1 phase spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic G2 phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic G2 phase spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A germ cell undergoing meiosis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic germ cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic metaphase I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic metaphase 1 stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic metaphase II | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic metaphase 2 spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic prophase II | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic prophase II spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic prophase I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic prophase I spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic S phase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic S phase spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic telophase II | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic telophase II spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing meiotic telophase I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand meiotic telophase I spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| pigment granule which is part of the eumelanin | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand melanin pigment granule relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A tissue-specific, membrane-bounded cytoplasmic organelle within which melanin pigments are synthesized and stored. Melanosomes are synthesized in melanocyte cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand melanosome relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand membrane relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function, bounded by a single or double lipid bilayer membrane. Includes the nucleus, mitochondria, plastids, vacuoles, and vesicles. Excludes the plasma membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand membrane-bounded organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any constituent part of a membrane, a double layer of lipid molecules that encloses all cells, and, in eukaryotes, many organelles; may be a single or double lipid bilayer; also includes associated proteins. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand membrane part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| germ cell cyst undergoing mitotic metaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand metaphase germ cell cyst relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neoblast undergoing mitotic metaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand metaphase neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial cell undergoing mitotic metaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand metaphase oogonial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| oogonial stem cell undergoing mitotic metaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand metaphase oogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonium undergoing mitotic metaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand metaphase spermatogonia relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatogonial stem cell undergoing mitotic metaphase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand metaphase spermatogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Thin cylindrical membrane-covered projections on the surface of an animal cell containing a core bundle of actin filaments. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand microvillus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The median line/ plane of bilateral symmetry along the anteroposterior axis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand midline relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A spherical to rod shaped organelle that generates the majority of a cell's supply of ATP via cellular respiration. Mitochondria have their own genome and consist of outer and inner membranes, the latter folds inward to form cristae. This folding increases the surface area of the membrane and thus increases the space available to produce ATP. The inner and outer membranes are separated by an intermembrane space, and the inner membrane encloses the matrix. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand mitochondrion relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An efferent neuron that passes from the central nervous system or a ganglion toward or to a muscle and conducts an impulse that causes or inhibits movement. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand motor neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The sole point of entry and exit for the Triclad planarian flatworm gut. The mouth is connected to the pharyngeal pouch to allow for exit and re-entry of the pharynx on the ventral side of the animal. The mouth contains several cell types, including epithelial cells, muscle, and secretory cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand mouth relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A secreted, mucin-rich extracellular substance coating the epidermal surface of the animal implicated in gliding locomotion, substrate adhesion, innate immunity and predator avoidance. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand mucus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An anatomical structure that has more than one cell as a part. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand multicellular anatomical structure relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neuron with an axon and two or more dendrites. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand multipolar neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A mature contractile cell, commonly known as a myocyte. This cell has as part of its cytoplasm myofibrils organized in various patterns. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Progenitor neoblasts implicated in the maintenance and regeneration of muscle fibers. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand muscle progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Total musculature of the planarian body. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand musculature system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A heterogeneous population of pluripotent, somatic adult stem cells and lineage primed progenitors that are required for maintenance and regeneration of all cell types in planaria, including the germline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The external opening and terminus of a protonephridium made by a terminal cell. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nephridiopore relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An enclosed, cable-like bundle of axons in the peripheral nervous system originating in a nerve root in the central nervous system (or a condensed nervous structure) connecting with peripheral structures. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nerve relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical junction where subdivisions of two or more neural trees interconnect with one another to form a network through which nerve fibers of the constituent nerve trees become regrouped; together with other nerve plexuses, nerves and ganglia, it constitutes the peripheral nervous system. Examples: cervical nerve plexus, brachial nerve plexus, sacral nerve plexus[FMA]. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nerve plexus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The nervous system is an organ system containing predominantly neuron and glial cells. In bilaterally symmetrical organisms, it is arranged in a network of tree-like structures connected to a central body. The main functions of the nervous system are to regulate and control body functions, and to receive sensory input, process this information, and generate behavior [CUMBO]. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nervous system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neoblasts and their differentiating daughters implicated in maintenance and regeneration of different tissues in the nervous system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neural progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell appendage of the neuron which includes the axon and the dendrite. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neurite relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The basic cellular unit of nervous tissue. Each neuron consists of a body, an axon, and dendrites. Their purpose is to receive, conduct, and transmit impulses in the nervous system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cells that are in close proximity to neurons. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neuron associated cell (sensu Nematoda and Protostomia) relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A fasciculated bundle of neuron projections (GO:0043005), largely or completely lacking synapses. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neuron projection bundle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron that produces and releases neuropeptides at chemical synapses. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neuropeptidergic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cluster of neurites that is part of a nervous system and forms a network of dendrites and axons where synapses are present and in which neuronal somata do not occur. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neuropil relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neuronal cells which synthesize, store and release neurohormones. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand neurosecretory neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Differentiating, immature epidermal cells lacking cilia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand non-ciliated epidermis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An epithelial cell lacking cilia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand non ciliated epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function, not bounded by a lipid bilayer membrane. Includes ribosomes, the cytoskeleton and chromosomes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand non-membrane-bounded organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The double lipid bilayer enclosing the nucleus and separating its contents from the rest of the cytoplasm; includes the intermembrane space, a gap of width 20-40 nm (also called the perinuclear space). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear envelope relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The inner, i.e. lumen-facing, lipid bilayer of the nuclear envelope. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear inner membrane relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The volume enclosed by the nuclear inner membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The outer, i.e. cytoplasm-facing, lipid bilayer of the nuclear envelope; continuous with the endoplasmic reticulum of the cell and sometimes studded with ribosomes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear outer membrane relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any constituent part of the nucleus, a membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear part relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The portion of the nuclear lumen proximal to the inner nuclear membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear periphery relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any of the numerous similar discrete openings in the nuclear envelope of a eukaryotic cell, where the inner and outer nuclear membranes are joined. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nuclear pore relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A small, dense body one or more of which are present in the nucleus of eukaryotic cells. It is rich in RNA and protein, is not bounded by a limiting membrane, and is not seen during mitosis. Its prime function is the transcription of the nucleolar DNA into 45S ribosomal-precursor RNA, the processing of this RNA into 5.8S, 18S, and 28S components of ribosomal RNA, and the association of these components with 5S RNA and proteins synthesized outside the nucleolus. This association results in the formation of ribonucleoprotein precursors; these pass into the cytoplasm and mature into the 40S and 60S subunits of the ribosome. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nucleolus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nucleus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A population of piwi-2+, ston-2+, elav-2+, ptprd-9+ and msi-1+ progenitors that give rise to one or more neuronal (pc-2+, synapsin+) lineages. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand nu neoblast relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurons that express the biogenic amine octopamine. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand octopaminergic neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Parenchymal cells that synthesize and contain brown ommonchrome pigment. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ommochrome pigment cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| pigment granule which is part of the ommochrome pigment cell | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A female germ cell that has entered meiosis. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An undifferentiated germ cell that proliferates rapidly and gives rise to oocytes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oogonial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A piwi-1+, nanos+ cell residing in the ovary that self-renews and give rise to oogonial cells that differentiate into oocytes. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oogonial stem cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A decussation of the diencephalon where the fibers of the optic nerve cross | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand optic chiasm relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A portion of the eye containing pigment cells and dendritic projections from photoreceptor neurons. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand optic cup relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A progenitor cell that gives rise to optic cup cells of the eye. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand optic cup progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A neuron projection bundle that connects the retina or its analog in the eye with the brain. This includes the vertebrate optic nerve (not truly a nerve) as well as analogous structures such as the Bolwig nerve in Drosophila. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand optic nerve relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Axis that runs from the oral pole and to the aboral pole of the spherical embryo (Stage 3 through early Stage 6). The oral pole is centered around the embryonic pharynx; the aboral pole is located opposite the embryonic pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oral-aboral axis of the embryo relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stage 3-5 embryo hemisphere centered around the embryonic pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oral hemisphere relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The orifice that connects the mouth to the exterior of the body. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oral opening relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical structure that performs a specific function or group of functions. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand organ relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organized structure of distinctive morphology and function. Includes the nucleus, mitochondria, plastids, vacuoles, vesicles, ribosomes and the cytoskeleton, and prokaryotic structures such as anammoxosomes and pirellulosomes. Excludes the plasma membrane. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand organelle relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A membrane that is one of the two lipid bilayers of an organelle envelope or the outermost membrane of single membrane bound organelle. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand organelle membrane relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A stage at which the ectoderm, endoderm, and mesoderm develop into the internal organs of the organism. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand organogenesis relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Body wall muscle fibers arrayed along the anteroposterior axis. Upon regeneration, these muscles are thought to be established from truncated pre-existing fibers. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand outer longitudinal muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ophis+ somatic cells (gh4-, nanos-) in the ovary that may provide trophic support to female germline stem cells and differentiating oogonia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ovarian somatic gonadal cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A gonad containing female germline stem cells which fuel oocyte production. Two ovaries are located ventally, underneath the body wall musculature, immediately posterior to the cephalic ganglia (brain) and adjacent to the ventral nerve cords. The neoblast compartment, including piwi-1+, nanos+ primordial germ cells, fuel formation of the ovaries during juvenile development. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ovary relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| lumen which is part of the ovary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ovary lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nerve plexus surrounding the ovary. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ovary nerve plexus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| This primordium develops into ovary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand ovary primordium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ciliated tubes adjacent to the ventral nerve cords, adjoining the tuba and the bursal canal, that transport fertilized oocytes to the genital atrium. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oviduct relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ciliated epithelial cells that assemble into the oviduct. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oviduct epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ciliated epithelium lining the oviduct. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oviduct epithelium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomical space enclosed by the oviduct epithelium. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand oviduct lumen relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| spermatocyte undergoing pachytene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pachytene stage spermatocyte relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the parapharyngeal region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region of the animal lateral to and surrounding the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand parapharyngeal region relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An orientation quality inhering in a bearer by virtue of the bearer having a position that is in the parasagittal plane, which runs longitudinally, and is never medial. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand parasagittal orientation relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A loosely organized collection of connective tissue and cells, including neoblasts and their immediate progeny, located in the space outside of the organs between the body wall musculature and the gut. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand parenchyma relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cell which is part of the parenchyma | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Muscles that are present through the mesenchyme, inclusing dorsal-ventral muscles, intestinal muscles and pharynx muscles. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand parenchymal musculature relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| piwi-1+, pax3/7+ progenitor neoblasts implicated in the production of DBH+ ventral midline neurons. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pax3/7+ neural progenitor cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A rounded protuberance, connected to the seminal vesicles, responsible for transferring semen into a mating partner's bursal canal. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand penis papilla relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A major division of the nervous system that contains nerves which connect the central nervous system (CNS) with sensory organs, other organs, muscles, blood vessels and glands. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand peripheral nervous system relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Any neuron that is part of a peripheral nervous system. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand peripheral nervous system neuron relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| An event or occurrence that causes damage to a tissue or organ. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand perturbation relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A cell that engulfs large particles or cells via invagination of the plasma membrane and creation of a phagosome. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand phagocytic cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A plicate and protrusible organ that is the sole point of entry and exit for the Triclad gut. It contains epithelial, muscular, secretory and neuronal cell types. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pharynx muscle fibers running circumferentially about the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx circular muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| epithelial cell which is part of the pharynx | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx epithelial cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Epithelia associated with the pharynx organ. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx epithelium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pharynx muscle fiber that runs circumferentially about the pharynx and lies just beneath the inner logitudinal pharynx muscle fibers. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx inner circular muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Epithelial cells lining the inside of the pharynx. In Smed, distally located cells are heavily ciliated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx inner epidermal cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Heavily ciliated epidermal cells covering the inner surface of the pharynx shaft. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx inner epithelium relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The epithelial surface lining the interior of the pharynx, facing the lumen. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx inner epithelium surface relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pharynx muscle fibers running anteroposterior which lie beneath both the inner circular muscle fibers and the apical, ciliated portion of the epithium lining the lumenal surface. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx inner longitudinal muscle cell relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ring of the pharynx nerve plexus that is proximal to the lumen. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expand pharynx inner nerve plexus relations
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||