neoblast
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Planarian Anatomy Ontology Class Overview
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NAME:
neoblast
DEFINITON:
A heterogeneous population of pluripotent, somatic adult stem cells and lineage primed progenitors that are required for maintenance and regeneration of all cell types in planaria, including the germline.
TERM CITATIONS:
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- PMID:24120894
- PMID:17905225
- PMID:20844018
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- PMID:30729158
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- PMID:21852957
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- PMID:30962434
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- PMID:27122174
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- PMID:21747960
- PMID:25356635
- PMID:25278423
TERM ID:
PLANA:0000429
ABOUT THIS TERM:
neoblast
↳is a anatomical entity, material entity, progenitor cell and stem cell ↳contained in tail, copulatory region, posterior compartment of the whole animal, parapharyngeal region, prepharyngeal region, head, dorsal region of the whole animal and anterior region of the whole animal
↳develops from blastomere
↳existence overlaps Stage 6, juvenile, Stage 5, asexual adult, adult hermaphrodite, Stage 8 and Stage 7
↳existence starts during or after Stage 5
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→ prophase neoblast
→ G2 phase neoblast
→ S phase neoblast
→ G1 phase neoblast
→ telophase neoblast
→ anaphase neoblast
→ metaphase neoblast
→ longitudinal muscle progenitor cell
→ circular muscle progenitor cell
→ serotonergic neural progenitor cell
→ klf+ sensory neuron progenitor cell
→ pax3/7+ neural progenitor cell
→ nu neoblast
→ anterior pole progenitor cell
→ TrpA+ neural progenitor cell
→ specialized neoblast
→ trail cell
→ clonogenic neoblast
→ gamma neoblast
→ zeta neoblast
→ sigma neoblast
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Additional Class Information
All experimental data displayed here is from Davies et. al., 2017, Smed Embryogenesis Molecular Staging Resource
FIGURES:
Figure 9: Ontogeny of the adult neoblast compartment.
Asynchronously cycling piwi-1+ cells fuel embryogenesis, giving rise to all temporary and definitive tissues. During S2, some piwi-1+ blastomeres (purple cells) exit the cell cycle and differentiate into temporary embryonic tissues (primitive ectoderm, temporary embryonic pharynx and primitive endoderm). The remaining piwi-1+ blastomeres, located in the embryonic wall (purple cells, S3-S4), continue to divide and express both early embryo enriched transcripts (turquoise arrow) and adult asexual neoblast enriched transcripts (red arrow). As organogenesis begins during S5, early embryo enriched transcripts are downregulated throughout the compartment (purple cells transition into red). Concomitantly, progenitor subpopulations required for definitive organ formation are specified via the heterogeneous expression of developmental transcription factors within the piwi-1+ population (colored cells denote different progenitor subpopulations). Adult pluripotent neoblasts, themselves a lineage, are established during S5 (red cells). Embryonic donor cells harvested during or after S6 function similarly to adult neoblasts (cNeoblast activity, gray arrow). Pluripotent and lineage-primed neoblasts established during embryogenesis are maintained throughout the lifetime of the animal, where they are required for tissue maintenance during homeostasis and formation of new tissue during regeneration.
IN SITU HYBRIDIZATION DATA:
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Abbreviation or symbol Definition O oral hemisphere A aboral hemisphere D dorsal V ventral L lateral black arrowhead embryonic pharynx red arrowhead definitive pharynx black arrows primitive gut yellow arrows primitive ectoderm cells cyan arrows brain cyan arrowheads nerve cords blue arrowheads eye progenitors (trail cells) purple arrowheads eyes scale bar 100 µm
SEQUENCES:
smed_20140614 transcript sequences for genes validated by in situ hybridization (above).
>SMED30010115 ID=SMED30010115|Name=ribonucleoside diphosphate reductase subunit M2-2|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=1127bp
GTTTTTAATGAACTGAATCAGGTTTAATGCAAAATAGTCATTTTAATTTCTAGATAAATTAACAGTAATTCTTTCGAGAT
TAGATATTTATTATGGAGATTTTATTAACAGAAGATAAAAGTCGAATAGGATTTCTTAATATACAATATGAAGATATATG
GGAAATGTTTAATAAAGCTCGATCTTCATTTTGGACTGTAAATGAAGTTAATTTATCAAAAGATTTTGCTCACTGGAAAA
AAATGAATGACGATGAACGGTATTTCATTACTCACGTTCTTGCATTTTTTGCTGCCAGTGATGGAATTGTCAATGAAAAT
CTCGTCGAAAGATTCATTCAAGAAGTGAAAATTCCCGAAGCTGAGGCATTTTACAGTTTTCAAATTGCAATTGAAAACAT
TCATTCAGAAATGTATTCTCTATTAATCGATTCTTATGTTACTGATACAGAAACAAAGAATAAATTATTTAATGCCATCG
AAACTATGCCATGCGTTCAGAAAAAAGCTCAATGGGCATTGCGTTGGATTAGCGATAAAAAATCCACTTTTGGAACTAGA
GTTGTTGCATTTGCTGCTGTCGAGGGAATATTTTTCAGTGGTAGTTTTGCATCGATATTTTGGCTTAAAAAGCGTGGATT
AATGCCCGGATTATGTTTCAGCAACGAATTAATTAGCCGAGATGAAGGACTTCATTGCGATTTTGCTTGTTTGATGTTTA
AATATTTAAGTAGCAAACCGTCACCTGAACAAGTTTTGGATTTGATCAAAGAAGCTGTCGGAATCGAGAAGGAATTTCTC
ACCGACGCATTGCCGGTTTCATTGATTGGCATGAACGCTGAATCGATGTGTGAGTATATTGAATTTGTGGCCGACCGGCT
GCTGGTTGAATTGGGCTGTGACAAGTTCTGGAACACAGAGAACCCGTTGGATTTCATGGATAATATTTGCATCGATGGGA
AAACTAACTTCTTTGAGAAACGAGTCGGTGAATATTCCATGTCGAGCGTTGAGGACAAACACAAATTTGATGATGTCAAT
TTCGATATTGATTTTTGAGGGATTCCGTTTTTTGGCGCCAGTGTGCATTTAATGTGTTTTGGTTGTAATTGGCTATTTTT
GTTTGTT
>SMED30007406 ID=SMED30007406|Name=SMEDWI-1|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=2730bp
AATCGAATACATAAAAATTTATTTGACACCAAATACAAAGAGACATTAATCTACAAGTAAAATAAGCGTTCGCGAATTCT
GTCATTTATCGCTGGAGGAGTAACACCACGATGAATCTTGCCAACGAGTTCAGCCAAACGATGGGCATAATGCGTTGGAA
CAGGAACTCGGATTGTTCCCATCCAGTTAAAATACAAATGTGTTAACGAATAAGTTATTTGCTGCAATACACTCGGAGAC
ATAACTGAAACCTCATTTGTTTTCTTGTTTGTAAACTTAGTGTCCATAAGAACATTATAATTCGTAGGAGATGCTGTACC
TTTAGTTGTTTTCTGAGACACCAAGTAAAATTCATAGAAATTGGGTTTCACTATTTTCTCATCAACCACAGTACCAGGAT
TTGGATTAGCCCCATCTTTGAAAAATTTAACACTAATTCTCTTCTTAACCACAACATAAATAATTTGGGGCAAAGTTTGA
TTTTCGTAAATTTTCTCTATCATTTTCATAACAGCATCAGTTTCGAACTTTTTGGTAAATGCTAACTGTGAATCTCCAAC
ACCGTCACGATAAATAATCAAACGAAGAGGCATAGTGTTAAATTTGTTTTGGAATGTTGTAAGGGCCGTTAGGAAGTTTT
TGCCCAAATTTTCGTGAAATTCATTTTTACCTTTAGATGAATTGACAAAACTGATATACTGAGAAAATTTGGCACTAATT
GAAAATACGGATGCTTGAACAGATCTTTTACCGGTTTTGCTATGAAAAGTATCCAATCCTACAATCATAGTCGGTGCCAT
TTTAAGATTAATACCCCATGGGTCGTATCCTAATTTAGAAAACATTTGCATAACTGATTTATCTGCAACCGTTTTACGAC
GTCGATCATCTCTATTACTTCCGTTTCTCTGCGTCACACACTGAGTCAATAGACCTGTAGACATTGTAAAATTCTTTACT
TTTGCGTAAACTTTATCATCAGGAATGAACACTAATGCCATATGTACCTTGCTTACACGAATAAAATCTGTTAAAGCGTC
TTCAACTTCATTGGATCGACATGAAGATATACTGTCCATTGTGTAATTGATTCTTAATCTTCCTATTTCTCTTTTAACAT
CTTCAATAAAATTGTTGAAGTGACTAGGGTTTCGATCAACAACCAGTACACCAAAACGATGAGCTGTGCCTTTAGGAACG
TCAAATTTAATTTCCCCAAACTTCCAATCATCAGGGATTTTAGTATTAATTTTAACTTCGTTTGAAAATATATCAACTGG
AGCCAATTCACGACCACGAATCGTAATCGGTTGTTCTTCAATACACATCCCCCAGCTCTTCATATAATCTTTTGATTTCC
CAGCTCCGGTCCACTTACAAAAATCTCTTATGTCATTTAATCGTTCTCTAGGCTCACGTTTCAATACGGTTCCTAAATTC
TTTTGCAAATTTATATTACTTCTTTCACTATCCGAAAATCCACATAAATAGCATAATTCACCTGGAATTGATAAACTTTG
ATCTGTTTCTGTAGGTCCTTCAGGTTCATTTTCAGTTTTTTTCTTTTGGGCGAACCATCGATCGCTTGACTCGCGATATA
ACAAATGGTTGTTTGTCATTTTTCAAATTAATGTTATACCGTTGCTTGAAATAATTCAAATAGGATATCTTTTTATCGCC
TAGCTGAACCTCGTCATTAACATCCATTTCTTTAATATCTGAAATTCTATACGTCTTGTTATTATACTTGGTAATTATGT
CCCTTCCTATTAATTGATCAATTTGATCTCGTCGATACACTGATACTACATTGTTTTCATTTAGAACACGATTAATTCTT
TCAAGATAAAGTAAAGTCGAAGCAGTTCCATTTTCATTTGTTCCTCTTGTAATTGTAGTAGAATACCCTCCTAATATCTT
GAAATTGTCCATTTTAAAAAAGCTAGGTCCTTCTCGAATACCACCACTTTCACAATTTGATCCCAGAAAAAATTGTCTAC
CAATTTTTTCTTGTCCCATAAATATTTGAATATTATTAAATACAATATTTATCATCTGATAATATTCTTCAGAATTTTTT
AAAAACGTCGTCAGCAATCGTATGGAAATTTCAACATCTTTGATAACTAAGTTTTCTGTATCTTCATCTGAGTGCCACTT
AGAAGTCGTAAATAATCTTCTGCCATCAAAACAAAATGGTTGACCATTATTTTTGCTGTTTGCATAAGCTAATAATAACT
CTAGCTTAGTACGGATACTTTTATTCTCCATAACTACATCATACATGTAAAATGGTCCTTCGACTTTAATATTAAAGTTA
GCGTAGTTAGACTTGAGACTAACTACTCTTCCATCTTTCCCTATTTTGTCTGTAACTGTATCAGGCTGTAAAGCAGGTTC
AATAATTGCGAATCTTCTTTGGAGACCTCCTCTTCTTGGTCTTAAATTGGGATCACTTGTAACATTAGTTGAATCCATTT
CGTAAATTTGAGTAAAAATGTTAAAACAAAGACTTCGGTTTAAATAAACAAAATATACTATGTAAAACGATAAATATAAT
TGCTTTAATGGTTTATGATTTGTATTATATAATAATAATAATTTAATTTCCCTGTGAATATTATATTAAAATATAGTAAA
AATTACTCGTAAATGTGTGTTAAAGTAATAGGATTAAATTAAAATAAACATTTTACGAAATAAGTTCTAGTCAATTATGA
AGTCTTTTCT
>SMED30004304 ID=SMED30004304|Name=Proliferating cell nuclear antigen|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=907bp
CTAAAAGGTAATAATTTAAATTTAATTAGAACATTGTTTTAATATTCGGTTATATTCTCCATTATTCTAAATTATGTTTG
AAGCAAAATTAATAAAAGGCGAAGTTTGGAAAAAGGTTATAGAAGCTATAAAAGACTTAGTACAAGAAGCAACATTGGAT
TGCTCAGAAAATGGAATTAGTCTTCAAGCCATGGATACATCTCATGTGTCCTTAGTTAGTATGCTTCTTCGAAGTGATGG
TTTTGAGACTTATCGATGTGATAGAAATGTCAATCTCGGTCTTAATATAACAAGTGTTTCAAAAATTTTAAAGGCGCTTG
GTAGTAATGATTCCCTAACAATGAAAGCCGCTGATTCAAGTGAAACAATTTCGCTTTTGATAGAATCTGCAAATGAAAAT
GAATTATCTGAATACGAAATAAAATTAATGGACTTGGATGGAGATCACTTAGGTATACCAGATACTGAATATAAGTGCAT
TGTGAAAATGCCGAGTTCAAAGTTACAAAGAATATGTCGAGATTTAAGCCAAATTGGAGAAGCAATCACGATTTGTGTTA
CTAAAGATGGTGTAACTTTTGCTGCTGCTGGAGATCTAGGAAAAGGAGCTATAAAACTTAATCAAAATTCTAGTGCTGAC
AAAGAAAATGAAGGAGTAACTATTGAAATGACCGAACCTGTTTCGATGACATATTCATTGAGGTATTTCAATATGTTTAC
AAAGGCTGCACCTCTTTCTTCTCAAGTATCTCTGTCGTTGACTGAAAATGTTCCAGCAGTTATTGAGTTCATAATCGAAG
ATTTGGGATTTATTCGATATTACCTAGCTCCTAAAATCGAAGACGACGAGTGAAAGTTTAACTATTAATGTTGTATGTTT
AATAGATGTTATTTTGTTTAAAAAAAA
>SMED30013909 ID=SMED30013909|Name=tud-1|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=2414bp
ATTTAGAAAATGGAGGCAACTTGCGATGTTTTTTTAACGAATTTACCTAAGTCGATTAATGAAGTAGTTGTGAAGAACTT
ATTTTCTTCTGCTGGGAAAGTGTTAAAAGTGAAAATAATAGATGACAAAAGAAACGAAAATCAGAAGCTATGCTTCGTTG
GATTTCGAACTATGGATGAAGCATTAGAAGCCGTCAGAATTGCAGATAAATCTGATGCGTTTGGTGATCCAATTAGAGCC
AGTATATCAAAGAAGTGTTTAGACGGAATGGAGAATAATCAAAATAGATCAAATAATAACAGAAATGATTCAAGTTATAA
AGGAACTGATTCATTTTCAAGAAAGAGTGATTCTAATTTCAAGGATAGTGAAAAGTATCCAACAAACAATGGTGACTTTG
CACAAGTAAATCGTTTAAACAACGTTGGAAGAGGAAGAGGAATCCAGACTAAAATTATTAGTGGTCCACCTTCATTCAAA
ACTAATGAAATTAAGTTAAACGATATTAAACTTAAAACAAAAGAACTGATTGACATCGAAATCGTCGATTTAAGTAGAGT
TGACATTATACTTATAAGGCCAGTAAAGTCAACGGAAAATTCAAAAATTGAAATAGCAGATTTATTGTCACAAATAAATT
CAAATAAATCGAATCTAATGCCAGTTGACTGTCCTAAAATAGGAGATTTTTGTCTTGCAAAATGGACTGAAGATGATTGC
TATTATCGGGCTGAATTGTTAGATATATTAAAGGATGGATCTTTCAAAGTTACTTTTGTTGATGAAGGAACTTCGGGTGA
TATTGTGACTGATTTGAAACACATTCCGACTGGTGCTTTACAGCAGTATCCTAAACAATTTTTGAAGGTTTCAATCGGTT
GCTCAGACGCAAAAGAATTAATGTCATTTATTTTACAAGAGTCTGAAGGAAAGGTGATTAAAATTTATTGGCTCGGAGAA
TATTGTGATTCCGTGCCTGTTGTAAATTTATTTCTGAATGAAGATGAAATTGTGGAAAAATATACCCAAATAAATAAAGT
AAATATCAGGAAAAAATTCTCACAGACATTTGATGATCTCCCAGTACATAACCTCGAAACTAATTCACATTTTTCAATAG
CACCATCAATGTATAAAAACCGAAATGATTTTATTCTTCAGATGAAAACTTTCTCGGTATCTTTAAAGCAAAAAAAATGT
CCTACGGTTTTACCAATTCCTGGTGATATATGTATATATGAGAAAAGGAATGCTAATGGCGAATCATTTCTTCGTTGTGT
TATATTAAGGCGCCAACTTTTTTCTTTTGACATCGAGTTAATAGATATCGGTGAAAAAATAATGAATGTTAATATTGATC
ACCTGTACACAGTCGAAGATATTCATGTAAAAGACGCTCCCTGTGCTATTACTTGCGATTTAGATAGTTCTATTAATATA
GATGGTATTAAGCTCCCTCAAGATTTGATCGATGGTGTTCTCTTTAATCTTAAAAAGTACAACAAAAATAATAAATACAC
TGTAAATTTCATTTTACCACAAAAGAAAGCTTATGAATATGCAAAAGTATCATATAAAGATTTGATTGGTAAAAGCTTTA
AAGTAATAATGTCGCACGTTGTCTCTCCCATTAATTTCTTTATTCAACTTGATGATGGAGAGCATCAGCTTGCACTTGGA
GATATTCAAGAAAAATTAAATATTAATTATAATGGATCACCATTCAAAAGTGCTAGCGATGTTAAAGAAACTCAGGCAGT
TATTGCTCCTTTTATTGTTTCCGGAAGTGATGCGGAACTTTTTCGGGCTTATGTTTTAGAGAAACGAAAGGAATCTCCAC
AAATTCATGTATTGTTTATTGATTATGGTAATGATGAATGGGTGAATTATGAAACTTTACTGAATACAAATGAAGAATTA
GTTTCTAAACCAGGTTTCGCAATACATTGTAAATTATCTCTAAATATTAAGAAGGAAGCGTGGAGTCACGCTATTGAATT
ATTTAATGATTTAGCTGGTTATACTGAAAATGACCAGGGGACGTTTGTAATGCAGGTTATTAGTGTCGATGGTGATTCGT
TAGTTGTGGACTTGATTTCAGAACTGAAAGGTTCGTTGACGGCCATCTTAGAAAAAAGTGGTACATGTGTAAAGTCCAAT
GAACCAATATGTAATGGAGGAGGACCCCAAGTTAAATTAAATGGCGTTTCAAATGATAAATCTCAATCAGCTATTCTTGA
AAATTTATCTGAAGGAGAATTATATAAAAAATTTATTGAACTAGAACGGAGATTAAGTGCTTTAGAGATATTGATGAAAT
AATGCTACCCGCGCAATTAGTATTATCAAATTATGATAATCTAGTCTTGATGTGTTTAAAATTTTGTATTTTAACATAAA
TTTATTCCGTGTTG
>SMED30025482 ID=SMED30025482|Name=Histone H4|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=552bp
TGTCATTATCAAAATATTTTCAATATATAATAAATCAGAAATCACTAAACAGTCATTACTAAACTATTCTAACTCAAAAT
GTCTGGTCGAGGAAAAGGAGGAAAAGGCTTAGGTAAAGGTGGAGCTAAAAGACATAGAAAAGTTTTGCGAGACAACATCC
AAGGAATCACGAAACCAGCTATTAGAAGGTTAGCTCGCAGAGGTGGCGTGAAAAGAATTTCTGGTCTTATCTATGAAGAA
ACTAGAGGTGTTTTAAAGGTTTTCCTTGAAAACGTAATCAGAGATGCTGTTACTTACACTGAACATGCTAAGCGTAAGAC
AGTCACAGCTATGGATGTTGTTTATGCACTTAAACGACAAGGTCGTACTTTATACGGTTTTGGAGGGCCACAAATGTTGA
TTGTAGTGAATTGTTCAAATATTGTTATTCTATCTAGTAATTCTCAGCAATTTTATTAACGTTATTTAGAAATTAATTTT
ACAATTGCTAATTTCGAATGTTATATCTGGTGTCAATGTTCAGTTATATTATTTTACAAATGACTTGAAATG
>SMED30001900 ID=SMED30001900|Name=CUGBP Elav-like family member 3|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=1713bp
CTTTTGAGGGAAAAATAATTCTTTTATTAATAATGTTTCATCATTGGAATATAAAATAAAATATTAGGAGAAAACATAAG
TTAACCAACAATATTAGCCACATATTTCGTTTAATTATTGGTCTATCACTTTTCATTTTAACCAATTGTCTTGAGATAAT
GGAGAGTTTATCCTTAATTTTTATTATAAATCACTGGTTTTGATAGACTTATTAACAATGGAAAATTATTTCAAACTTTT
CGTTGGTCAGATACCTCGAAATACACCAGATAAAGAAATTAGACTTATTTTTGAAGCTTTTGGACCAATCTTTGAATTTT
TAATTTTAAGGGACAAGAAAACTGGTTTTCATAAAGGATGTGCTTTTGTTACATTTTATCATAAAGACTCTGCAGAAAAT
TGTCAAAAGGCGTTACATGACAAGAAAATCCTAAACGGGATGAATCGACCACTTCAAGTGAAACCAGCTAAAAATAAGTT
AGCAAAAAATTCAAGTTTGAATGGGGAAAATCAGACAGAAGAGCAGGTTTTCAGTGATGAAAGGAAATTGTTTGTTGGAA
TGTTGAGTAAAAATCAAACTGATGAAAATGTACAAAATATGTTCACAAAATTTGGCAAAATCGAAGAGTGCACTGTATTG
AAAGACCAAAATGGAAATAGTAAAGGATGTGCCTTTGTCAAATTCGTGAACCACACCGATGCTTGTGCAGCAATAAACGC
TCTTCATGCCAGTCAAAAAATGGAGGGTGCTTCATCCAGCCTTGTGGTTAAATTTGCTGACACGGATAAACAAAAACAAA
TAAGAAAATTGCAGCAATATATTCCAGATTTAAGCATTTTAAATTCGCGCATTCCTATTAATATTCCATACTATTCACAA
TACGGTACAATAATTAATCCAGAATATAATTCAACAATTCCTTCAAACCAATATATTCGAAATTGTAACGAATATATTCT
TGCTGCTCAAATTCAACAAATAAATTTGTTTTCTAATTTATCATCGGTCTACCCATCTAATTCAATAGTGTCAATGCCAT
CCAGCCATCCGGTACCAATGATTGACTATTCTGTTCCTATTAACAACTTTCCACAAACTGACCAAATAACAATGAAACCA
ATTGTTGATATACAGCCAATACCTCCAGAAGCTGTACACCGAACCATCGTAACTCCAGGATCACTCTTATCATATCCTTT
TCTTAATGTTCAAATTCCTACAGTATATCCAAACGCCTTTTCCAATGGAAATTTAACAAGTACAACACAAAGTTCAACAG
ATGTGAAAACCACTCCTTTGCCAACAGGTCCTGAAGGCTGCAATCTATTTATTTATCATCTGCCACAAGAAATTGGTGAT
TTACAATTATATCAAATTTTTATGCATTTTGGAAACGTTATCAGTTCTAAAGTTTATGTTGACAGAGCAACAAATCAAAG
CAAATGTTTTGGATTTGTCAGCTACGATGATCCGGCATGTGCCAATGCCGCCATCAAATCTATGAATGGATATCATATCG
GAACAAAAAGATTAAAAGTTCAGTTAAAAAAACCAAAAGAAGCAATAAACGAAATGAAAAACTTCAATCAAATGTTATCA
TCAACTCCCGACATAAACCAAGTATTTTGTTCATCCTAATGATTGTGATATTTTACAGGATTTTCTCGACCATATTGAAA
GCCTGATTGGTGATATGTAAAATGACCCACCGT
>SMED30022389 ID=SMED30022389|Name=Proliferating cell nuclear antigen|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=915bp
GTTATTAACGTTATTGGACTATAGTTTTATTATCATAAATTTTTGAATAAAATTGAGATCTTCTTTTAATAATGCTATTT
GAAGCAAAATTAAATAAAGTAGATGCATTTAAAAAGCTGATTGATTCGGTTAAAGAATTAATCCAAGAAGCAGTTTTTGA
ATGTTCATCCAAAGGTATTGAATTACAAGCAATGGATAGTTCACATGTTAGTCTAATATTTCTTTTAATTAAAAAGCAAT
CTTTTTCGTCTTATAAATTTACGAGAAATGTATCTTTGGGTGTAAGTCTTGTAAGTCTATGTAAAATACTCAAACTTTCT
CAAATTAATGATTCAATTACAATTAAAGTTGATAATGAATGTGAAACAGTCGAATTTGTTTTCGAATCATCAGATAGTGA
TCGAATGTCTGAATTCAGTTTGAAGTTAATTGACTTGGATATTGACTGTTTAGCTATTCCGGAATCAGACTATGATTGCG
TAGCAACAATCCCGTCTGTAGAATTTAACAAAATATGCCAGCAATTAGCTGTTATTGGAAGCACTGTAACAATTGTAGTA
ACTAAACAGTCAATTCAATTTTCTTGCTCCGGAGACATGGGGAAAGGGAAAATATTATTAAATCAAACTGTAAATAAACC
GAGAATAGAAGATTCTATTAATATTGAAGTTGTTAATCCATTATCAATGGTTTACTCGCTTCGATTTTTTCATATATTCT
CGAAGGCCTATTCGCTTAGCAACAGAGTTTCTTTATCTTTTGCTAATAATTTCCCAGCTTTGGTGGAGTACAGCATGAAT
GAATTGGAAGGTCATCTACGATTTTACTTAGCTCCAAAATTAGATGATGATTGATTTTGCTCTTTTTCTAGTTTTGGGGT
GATATTTTAATTGTAGTGCTTTTTTAGTATGGTTA
>SMED30019097 ID=SMED30019097|Name=SOXP-1|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=1596bp
GGAATAACAGCCAATTAGGGATCAGCTGCAATTTGGCCTATGATTGGACATTGATTTTTATAGTCTCAGGCGTTCTCAGC
TTACGTGTGCACCTTTTTAGTGGACACGTTAAATTTGATAGGTGCTTAGTGGTGTTGATTCCTGTTTGGAAACTGTATAT
AACCAAGGTTATTTGTTGCTTTGAGACAAATGCAACACAATCAAATAATTAATTATGCTATGTTCAAATTGTTCAAACAA
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GAGAAGGGATATATATTTACCAACAAGAAAAATGTTTTGAATTTAAGAATAGGACTC
>SMED30014446 ID=SMED30014446|Name=SMEDWI-2|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=4773bp
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AGGAAAAGGGTTAGGAAAAGGTGGAGCCAAGCGTCATCGTAAGGTTTTACGTGATAACATTCAAGGAATAACTAAGCCGG
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TATAAAGCTTTTGTAACGCCTTTTCTATACAGATGTTCGATATATATATATAAATAAATAAATATAAATATATAACAATT
TTATTGACATTGTACAGTATTCCATAAGCCCGATCTTGTAACGCATTTATTACTATACTCAATAGACCAATCTATATGTT
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GCTCTCCGCCGCCGCCATTCGGTGTAAATATCAATTGCATTGCCAGCACGTTTTCTCAAACTCAATTTTTGTACTCAATT
TCAATTGATTTATGTTCATTTTATTTTTCATAGAAATGAGTAAATAAATTTTCATAAATAGTTTTGTTTTCAATATTTTT
AGGAAATTTGAATGTGTCTCTAGA
↳contained in tail, copulatory region, posterior compartment of the whole animal, parapharyngeal region, prepharyngeal region, head, dorsal region of the whole animal and anterior region of the whole animal
↳develops from blastomere
↳existence overlaps Stage 6, juvenile, Stage 5, asexual adult, adult hermaphrodite, Stage 8 and Stage 7
↳existence starts during or after Stage 5
Expand to see terms that develops from neoblast
Expand to see terms that is a neoblast
→ prophase neoblast
→ G2 phase neoblast
→ S phase neoblast
→ G1 phase neoblast
→ telophase neoblast
→ anaphase neoblast
→ metaphase neoblast
→ longitudinal muscle progenitor cell
→ circular muscle progenitor cell
→ serotonergic neural progenitor cell
→ klf+ sensory neuron progenitor cell
→ pax3/7+ neural progenitor cell
→ nu neoblast
→ anterior pole progenitor cell
→ TrpA+ neural progenitor cell
→ specialized neoblast
→ trail cell
→ clonogenic neoblast
→ gamma neoblast
→ zeta neoblast
→ sigma neoblast
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Additional Class Information
All experimental data displayed here is from Davies et. al., 2017, Smed Embryogenesis Molecular Staging Resource
FIGURES:
Figure 9: Ontogeny of the adult neoblast compartment.
Asynchronously cycling piwi-1+ cells fuel embryogenesis, giving rise to all temporary and definitive tissues. During S2, some piwi-1+ blastomeres (purple cells) exit the cell cycle and differentiate into temporary embryonic tissues (primitive ectoderm, temporary embryonic pharynx and primitive endoderm). The remaining piwi-1+ blastomeres, located in the embryonic wall (purple cells, S3-S4), continue to divide and express both early embryo enriched transcripts (turquoise arrow) and adult asexual neoblast enriched transcripts (red arrow). As organogenesis begins during S5, early embryo enriched transcripts are downregulated throughout the compartment (purple cells transition into red). Concomitantly, progenitor subpopulations required for definitive organ formation are specified via the heterogeneous expression of developmental transcription factors within the piwi-1+ population (colored cells denote different progenitor subpopulations). Adult pluripotent neoblasts, themselves a lineage, are established during S5 (red cells). Embryonic donor cells harvested during or after S6 function similarly to adult neoblasts (cNeoblast activity, gray arrow). Pluripotent and lineage-primed neoblasts established during embryogenesis are maintained throughout the lifetime of the animal, where they are required for tissue maintenance during homeostasis and formation of new tissue during regeneration.
IN SITU HYBRIDIZATION DATA:
Click to see image symbols and abbreviations
| Abbreviation or symbol | Definition |
|---|---|
| O | oral hemisphere |
| A | aboral hemisphere |
| D | dorsal |
| V | ventral |
| L | lateral |
| black arrowhead | embryonic pharynx |
| red arrowhead | definitive pharynx |
| black arrows | primitive gut |
| yellow arrows | primitive ectoderm cells |
| cyan arrows | brain |
| cyan arrowheads | nerve cords |
| blue arrowheads | eye progenitors (trail cells) |
| purple arrowheads | eyes |
| scale bar | 100 µm |
SEQUENCES:
smed_20140614 transcript sequences for genes validated by in situ hybridization (above).
>SMED30010115 ID=SMED30010115|Name=ribonucleoside diphosphate reductase subunit M2-2|organism=Schmidtea mediterranea sexual|type=transcript|length=1127bp
GTTTTTAATGAACTGAATCAGGTTTAATGCAAAATAGTCATTTTAATTTCTAGATAAATTAACAGTAATTCTTTCGAGAT
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GGAAATGTTTAATAAAGCTCGATCTTCATTTTGGACTGTAAATGAAGTTAATTTATCAAAAGATTTTGCTCACTGGAAAA
AAATGAATGACGATGAACGGTATTTCATTACTCACGTTCTTGCATTTTTTGCTGCCAGTGATGGAATTGTCAATGAAAAT
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TCATTCAGAAATGTATTCTCTATTAATCGATTCTTATGTTACTGATACAGAAACAAAGAATAAATTATTTAATGCCATCG
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