Browse webpages dedicated to embryonic tissue types and development of the definitive organ systems. Each page contains an overview. Terms with a star (☆) indicate pages with in-depth written descriptions, associated supplemental figures, in situ hybridization images and sequences for transcripts validated by WISH.
▻ organism subdivision
▻ anatomical system
▻ organ
▻ tissue
▻ cell
▻ developing anatomical structure
▻ regenerating anatomical structure
organism subdivision
term | definition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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anatomical region | A subdivision of an anatomical compartment. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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definitive organism subdivision | Anatomical structure which is a subdivision of a whole adult or juvenile organism, consisting of components of multiple anatomical systems. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
embryonic subdivision | Anatomical structure which is a subdivision of a whole developing/ embryonic organism, consisting of components of multiple anatomical systems. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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anatomical system
term | definition | |||||||
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digestive system ☆ | Anatomical system that has as its parts the organs devoted to the ingestion, digestion, and assimilation of food and the discharge of residual wastes. | |||||||
integumental system ☆ | Connected anatomical system that forms a barrier between an animal and its environment. In vertebrates, the integumental system consists of the epidermis, dermis plus associated glands and adnexa such as hair and scales. In invertebrates, the integumental system may include cuticle. | |||||||
musculature system ☆ | Total musculature of the planarian body. | |||||||
nervous system ☆ | The nervous system is an organ system containing predominantly neuron and glial cells. In bilaterally symmetrical organisms, it is arranged in a network of tree-like structures connected to a central body. The main functions of the nervous system are to regulate and control body functions, and to receive sensory input, process this information, and generate behavior [CUMBO]. | |||||||
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renal system ☆ | The renal system is an anatomical system that maintains fluid balance and contributes to electrolyte balance, acid/base balance, and disposal of nitrogenous waste products. | |||||||
reproductive system | Anatomical system that has as its parts the organs concerned with reproduction. | |||||||
secretory system | Anatomical system that has as its parts cells and glands devoted to the discharge of substances such as mucus. | |||||||
sensory system | Anatomical system that overlaps the nervous system and is responsible for receiving and processing sensory information. | |||||||
visual system ☆ | The sensory system subserving the sense of vision. |
organ
term | definition | ||||||||||||||||||||||||||||
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auricle | A sense organ located along the dorsolateral head margin. The auricular groove is highly innervtated by ciliated sensory neurons, and has an altered epidermis devoid of rhabdites and gland cells. | ||||||||||||||||||||||||||||
body wall musculature | Any collection of muscles that is part of a body wall [Automatically generated definition]. | ||||||||||||||||||||||||||||
cephalic ganglia | The planarian brain, consisting of two bilaterally symmetric lobes occupying a ventral position in the head. | ||||||||||||||||||||||||||||
epidermis | A single cell layer of post-mitotic epithelial cells containing ciliated and non-ciliated cell types forming the exterior surface of the animal. | ||||||||||||||||||||||||||||
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extraembryonic organ | Organ that is associated with an embryo and derived from the zygote from which it develops, but which does not contribute to the embryo proper or to structures that are part of the same organism after embryogenesis. | ||||||||||||||||||||||||||||
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eye | An organ that detects light. | ||||||||||||||||||||||||||||
gut | The planarian triclad gut contains a central anterior gut branch connected to two posterior gut branches arranged around the pharynx. Secondary gut branches extend laterally from the primary gut branches, while tertiary gut branches extend from the secondary branches. Food and waste enter and exit the gut through the pharynx. | ||||||||||||||||||||||||||||
mouth | The sole point of entry and exit for the Triclad planarian flatworm gut. The mouth is connected to the pharyngeal pouch to allow for exit and re-entry of the pharynx on the ventral side of the animal. The mouth contains several cell types, including epithelial cells, muscle, and secretory cells. | ||||||||||||||||||||||||||||
parenchymal musculature | Muscles that are present through the mesenchyme, inclusing dorsal-ventral muscles, intestinal muscles and pharynx muscles. | ||||||||||||||||||||||||||||
pharynx ☆ | A plicate and protrusible organ that is the sole point of entry and exit for the Triclad gut. It contains epithelial, muscular, secretory and neuronal cell types. | ||||||||||||||||||||||||||||
protonephridia | Excretory organs consisting of flame cells, proximal tubules, and distal tubules connected to a mesenchymal collecting duct. | ||||||||||||||||||||||||||||
reproductive organ | An organ involved in reproduction | ||||||||||||||||||||||||||||
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ventral nerve cord | The pair of closely united ventral longitudinal nerves with their segmental ganglia that is characteristic of many elongate invertebrates (as earthworms)[BTO]. A large process bundle that runs along the vental mid-line extending from the ventral region of the nerve ring[WB]. The ventral cord is one of the distinguishing traits of the central nervous system of all arthropods (such as insects, crustaceans and arachnids) as well as many other invertebrates, such as the annelid worms[GO]. | ||||||||||||||||||||||||||||
visceral musculature | Musculature surrounding internal organs of the body. | ||||||||||||||||||||||||||||
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tissue
term | definition | |||||||||||||||||||||||||||||||
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adhesion gland | Groupings of specialized epithelial cells located along the dorsal ventral margin. Adhesion glands are comprised of three cell types, the viscid and releasing gland cells which penetrate through an epithelial anchor cell and terminate at the epidermal surface. | |||||||||||||||||||||||||||||||
axon tract | A group of axons linking two or more neuropils and having a common origin, termination | |||||||||||||||||||||||||||||||
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brain visual center | Region of the cephalic ganglia innervated by the optic nerve (posterior-projecting photoreceptor neuron fasiculated axons). | |||||||||||||||||||||||||||||||
bursal canal | The passageway connecting the genital atrium to the copulatory bursa. Part of the copulatory apparatus. During mating, sperm from a partner is deposited into the bursal canal, where it collects in the copulatory bursa before travelling up the oviducts to the tuba. | |||||||||||||||||||||||||||||||
cement gland | Glands surrounding the genital atrium that are required for production of the proteinaceous egg capsule shell and stalk. | |||||||||||||||||||||||||||||||
cephalic ganglia lobe | One of two bilaterally symmetric structures comprising the planarian brain. | |||||||||||||||||||||||||||||||
collecting duct | Non-ciliated tubules associated with the distal tubules, which cross the basement membrane and terminate in the dorsal epidermis. | |||||||||||||||||||||||||||||||
commissure | A bundle of nerve fibers crossing from one side to the other side of the brain or spinal cord. | |||||||||||||||||||||||||||||||
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distal tubule | Sinusoidal, non-ciliated tubules connected to proximal tubules within the parenchyma. Tubules are formed via intercellular junctions between two epithelial cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||
epithelium | The avascular cellular layers that cover body surfaces and cavities and may form glands. | |||||||||||||||||||||||||||||||
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esophagus | Attachment between the triclad gut and the proximal end of the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||
flame bulb | Terminal structure of protonephridia unit; consists of flame cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||
ganglion | A biological tissue mass of nerve cell bodies. | |||||||||||||||||||||||||||||||
gut branch | The triclad planarian gut is serially bifrucated into connected lumens where each bifrucation is a branch. | |||||||||||||||||||||||||||||||
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inner zone of gland cells | Gland or secretory cells sandwiched between muscle and epidermal layers in the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||
lateral branch | Nerve branches that extend from the lateral side of each cephalic ganglia lobe. Each lobe has nine lateral branches which terminate in sensory organs. Evidence suggests they play a role in chemosensation. | |||||||||||||||||||||||||||||||
lateral nerve | A nerve extending laterally from the ventral nerve cord that innervates the submuscular plexus. | |||||||||||||||||||||||||||||||
nerve | An enclosed, cable-like bundle of axons in the peripheral nervous system originating in a nerve root in the central nervous system (or a condensed nervous structure) connecting with peripheral structures. | |||||||||||||||||||||||||||||||
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nerve plexus | Anatomical junction where subdivisions of two or more neural trees interconnect with one another to form a network through which nerve fibers of the constituent nerve trees become regrouped; together with other nerve plexuses, nerves and ganglia, it constitutes the peripheral nervous system. Examples: cervical nerve plexus, brachial nerve plexus, sacral nerve plexus[FMA]. | |||||||||||||||||||||||||||||||
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neuropil | A cluster of neurites that is part of a nervous system and forms a network of dendrites and axons where synapses are present and in which neuronal somata do not occur. | |||||||||||||||||||||||||||||||
optic cup | A portion of the eye containing pigment cells and dendritic projections from photoreceptor neurons. | |||||||||||||||||||||||||||||||
parenchyma | A loosely organized collection of connective tissue and cells, including neoblasts and their immediate progeny, located in the space outside of the organs between the body wall musculature and the gut. | |||||||||||||||||||||||||||||||
pharynx musculature | The total musculature within the pharynx. | |||||||||||||||||||||||||||||||
pharynx pouch | An epithelial structure housing the pharynx, connected to the esophagus and mouth. | |||||||||||||||||||||||||||||||
pharynx tip | The distal-most end of the pharnyx containing an opening to the pharynx lumen. | |||||||||||||||||||||||||||||||
proximal tubule | Ciliated epithelial cells form tubules, generating coiled, branching units terminating in flame bulbs. Tubules are formed via intercellular junctions between two epithelial cells. Proximal tubules are connected to non-ciliated distal tubules within the parenchyma. | |||||||||||||||||||||||||||||||
rhabdome | The light sensing structure consisting of photoreceptor neuron dendrites that project into the optic lumen and show close associations with eumelanin-containing pigment cup cells. | |||||||||||||||||||||||||||||||
secretory duct | A tubular structure that transports secreted or excreted substances. | |||||||||||||||||||||||||||||||
vitelline gland | Glands surrounding the oviducts which produce yolk cells. Yolk cells deposited into the oviducts travel to the genital atrium where they are packaged, along with one or more zygotes, into developing egg capsules. |
cell
term | definition | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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embryonic cell | A cell of the embryo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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germ cell | 1. A gamete (as an egg or sperm cell) or one of its antecedent cells. 2. A mature male or female germ cell usually possessing a haploid chromosome set and capable of initiating formation of a new diploid individual by fusion with a gamete of the opposite sex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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postsynaptic cell | A specialized area of membrane facing the presynaptic membrane on the tip of the nerve ending and separated from it by a minute cleft (the synaptic cleft). Neurotransmitters cross the synaptic cleft and transmit the signal to the postsynaptic membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
progenitor cell | A cycling neoblast and/or post-mitotic cell that is primed or irreversibly committed to a tissue-specific differentation program | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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somatic cell | One of the cells of the body that compose the tissues, organs, and parts of that individual other than the germ cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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stem cell | A relatively undifferentiated cell that retains the ability to divide and proliferate throughout life to provide progenitor cells that can differentiate into specialized cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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X1 cell | A sorted cell population enriched for irradiation-sensitive, cycling cells (4n cells, with high levels of Hoescht 33342 staining) with scant cytoplasm (low levels of calcein-AM staining). X1 cells are enriched for cycling neoblasts. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X1(FS) cell | A heterogeneous sorted cell population of unstained planarian cells with similar size and complexity to irradiation-sensitive, cycling cells contained in the X1 gate. Unlike X1 cells, X1(FS) cells are amenable to cell transplantation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X2 cell | A sorted cell population containing irradiation-sensitive and irradiation-insensitive cells, characterized by weak Hoescht 33342 and calcein-AM staining. X2 cell populations contain neoblasts as well as a variety of lineage-dedicated post-mitotic progenitor cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xins cell | A sorted cell population of irradiation-insensitive cells that contains a variety of post-mitotic, differentiated cell types. |
developing anatomical structure
term | definition | ||||
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embryonic structure | Anatomical structure that is part of an embryo. | ||||
extraembryonic structure | A multicellular anatomical structure that is associated with an embryo and derived from the zygote from which it develops, but which does not contribute to the embryo proper or to structures that are part of the same organism after embryogenesis. | ||||
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regenerating anatomical structure
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blastema | A regenerating tissue composed of a proliferative mass of undifferentiated progenitor cells from which new differentiated structures arise. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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fragment | A piece of tissue isolated from the body. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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primordium | Primordia are populations of contiguous cells that are morphologically distinct and already correspond in extent to a later organ/tissue. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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